2013年4月23日，中心顺利通过以王浩贤为组长的方圆标志认证集团有限公司审核组ISO9001质量管理体系审核。

审核主要涉及管理者代表、生产科、业务科(经营科)、质检科、总工办、GIS保障部、办公室、人事科、信息服务部、数据工程部（信息工程一部）、航测工程部（信息工程二部）等，以现场管理审核、程序文件执行度、相关表单及记录为主，包括面谈、观察活动及评审文件和记录。

在审核过程中，专家们对中心各个部门进行了严格的审核，对个别地方提出了整改意见。审核组对中心ISO9001质量管理体系进行了深入细致地审核后认定，中心质量管理体系符合ISO9001的各项规定要求，考核通过。

中心于2004年首次通过ISO9001质量管理体系认证，并且在此后的工作中不断升级。中心坚持“坚持科技创新、完善管理体系、构建数字时空、实现诚信服务”的质量方针，努力提升市场开拓能力，大力拓展业务范围。同时，切实增强质量意识，不断改进质量管理体系文件，建立持续改进机制并取得一定成效，产品质量稳定，质量管理体系运行有效。